《摄论》则是地道的妄心唯识学作品，全名《摄大乘论》，为世亲之兄无著菩萨所造，世亲对该论也作有释文流行，是世亲晚期的作品。因此牟宗三断言，世亲早晚期的思想不一致，并由此开出了唯识学的真妄二系，早期思想偏于真心，晚期思想侧重妄心，根据牟宗三的一贯思路，认为世亲早期思想要高于晚期。

    真谛是以讲《摄论》为主的摄论师，于梁武帝时来华，但是其翻译《摄论》背离原义，多有增益，试图将妄心系统转向真心系统。譬如《摄论》中，无著以阿赖耶识为迷染，真谛则用“如来藏自性清净心”来说阿赖耶识，不但是流转因，还是还灭因，全面自觉的从自性清净心来解释阿赖耶识，和《摄论》正相反。另一增益的译解是灭阿赖耶识而证阿摩罗识，转第八识成第九识，对此，牟宗三指出，凡是后来玄奖翻译为“转依”的，真谛都译为阿摩罗识，转依是一切法之种子所依者—阿赖耶识;而真谛的阿摩罗识，是智境无差别之流行，是一清净心之流行。玄奖的翻译，语法清晰而严整，是符合原义的，真谛则意在发挥。从无著世亲兄弟的原义来看，也只有八识，只不过转染成净后，成为净八识，不以净八识为第九识。后来真谛又翻译《大乘起信论》为唯识宗的基本经典，可以说为真心理论的发展开辟了源头。

    而为人熟知的唐僧取经，正是由于玄奖对真谛的翻译不满，力图了解唯识之原义，恢复原典的正确翻译所做出的壮举，后来玄奖根据其留学印度之所学所思，著《成唯识论》，开创了正式的唯识宗。

    故牟宗三把《地论》师和真谛的《摄论》思想判为前期唯识学，玄奖的《成唯识论》为后期唯识学，前期唯识开出真心方向，后期唯识往妄心方向走。牟宗三认为，真心唯识学以自性清净心为主体，以虚妄熏习为客尘，而宴心唯识学以无明妄心为主，正闻熏习为客。真心派认为阿赖耶识“以解为性”，妄心派认为其“迷染为性”;真心派依靠“如来藏自性清净心”，妄心系认同“如来藏自性清净理”。从实践的存有论而言，真心派是纵贯系统，妄心系派是横摄系统，“此存有论之完成定在唯真心之纵贯系统下始完成”。