对于这一套宇宙缘起论或发生论，正是要说明宇宙缘起的产生过程，不可能像原始佛教上面所说的从烦恼、迷惑、无知的立场来说明缘起。因为如果出发点不纯洁，就不能产生一套纯洁的世界。华严哲学作为大乘佛学不可能再回头，所以不可能采取原始佛教或小乘佛学里面的“业惑缘起说”。另外华严哲学也不可桃像法相唯识宗只是根据阿赖耶识来说明一切法的缘起，因为阿赖耶识在《楞伽经》里面，是属于“染净同位”:一方面是“染位的阿赖耶”;另方面又是“净位的真如”。照这种说法来看，到底应该要如何才能把第八识里面的一切烦恼、一切迷惑，都排遣出去，而成为清净法身。这是一个很大的问题。因为在《楞伽经》里面，几乎没有办法解决这个问题，由于该书只讲法相，而不讲法相，所以看不到法身的本体，及法身的根本属性。在人类宗教经验的领域中，及根据宗教经验所产生出来的反而使偏向于哲学方面的理解，而不是直接从宗教去把握真理。所以当我们在研究法相宗时，便发现，在整本《楞伽经》，同根据《楞伽经》里面所阐扬的《瑜伽师地论》，或者《显扬圣教论》，及后来的《成唯识论》、《百法明门论》等，说来说去，都是属于知识方面的分析问题，譬如阐述所谓能所二元对立的问题，但是都没有得到解决。这样才逼出了《解深密经》，在八识之外，八识之上再提出，即所谓第九识，把第九识当做‘纯净识”。如此才算解决了善恶能所二元对立诸问题。

    然而在华严哲学里面，它起码是要像佛学里面的如来藏系的那些经典，譬如像《解深密经》、《密严经》、《大乘起信论》等所说的，才可以超越法相宗所说的价值学二元对立的这一种理论的困难。也可以说，我们必须要能够把握佛性本身，将它当做是清净的真如，或当作是一个如来藏，因为它本身的精神就是美满价值的典范，由此出发，才能解释宇宙的缘起作用，或宇宙的发生作用。因为这个作用本身，一定要从佛性的本体讲起，这样，我们便可以解说宇宙里面怎么能够超脱罪恶、解脱罪恶。然后再由这个本体论去阐发宇宙万象的发生过程，及其在发生过程中，所产生的这一种作用。