秦汉以及唐代陵墓位于西安，而明朝明孝陵则位于今江苏省南京市，在著名的钟山南麓。明朝时期，风水学已经日益发展至成熟，朝廷当中不少为朱元璋选择帝陵位置的官员，都通晓风水之术，并掌握形势派和理气派的相关理论。
明朝开国军师刘伯温对天文地理以及阴阳术数有很高造诣，故太祖朱元璋令刘伯温为其选择陵墓位置。钟山背后青山环绕，前面临湖，是一块“藏风纳气”的风水宝地，故刘伯温与风水师最后选定钟山作为陵墓置地。明人张岱《陶庵梦忆》载:“明太祖与刘诚意(诚意伯刘基)、徐中山(中山王徐达)、汤东既(东瓯王汤和)定寝穴，各志其处藏袖中，三人合，穴遂定。门左有孙权墓，请徒。由此可以看出，选定陵墓位置的主要原因是前山后水的格局，并且好的格局是众人之所向。
风水学的发展，在明孝陵选址中，可以发现更多更详尽的陵墓选址依据。孝陵在钟山南面，陵墓整体坐北朝南。而钟山自西向东三座山峰，在风水上被称为“华盖三峰”，中间山体最高，形成了龙脉“玄武”之象。在三座山的整体形势中，三座山呈弧形，且弧口向南，构成了“玄武低头”之势。孝陵水流情况也与风水要求相应，由于在长江中下游，雨水较多，故充分考虑设计了排水系统。整个陵墓区域水系主要从陵墓后的山峰间流出，围绕陵墓主体，最后汇入西南方的前湖中，这就是风水学中所称谓的“朱雀翔舞。”
由以上分析可以得出，陵墓的选址符合风水中龙、穴、砂、水各方面要求。