1、农村殡葬设施在城乡建设中得不到重视
虽然近年来国家颁布了诸多政策，要求各级政府重视公益性公墓建设，但有的地方把公益性公墓单纯作为一项民政业务来抓，没有从经济社会发展全局的高度来认识把握，仅仅作为上级政府布置的任务来完成，并且在很多地方的城乡总体规划和乡村振兴战略规划中均缺少统筹布局。
2、用地限制条件严格，建设制约因素较多
“根据国家有关规定，在耕地、林地、城市公园、风景名胜区和文物保护区、水库及河流堤坝附近和水源保护区、铁路、公路主干线两侧等区域内均不得建设公墓”，并且还要考虑城市未来发展走向以及建设用地布局等因素，因此要找到符合这些条件又相对集中连片的土地非常困难。即使选出一块不涉及上述禁建区域的地方，可能也不符合土地利用总体规划以及林地保护规划等。另一方面从区位地势条件来看，相比于丘陵或山区地区，交通便利、易于建设的平原地区本身也比较适合公墓选址。如果公墓位置距离太远、交通不便，村民还是不愿意去，特别是很多村民还会考虑风水问题。
3、政府资金投入较大，工作主动性不高
农村公墓属于公益性公墓，因此具有公益性特性，建设资金往往投入很大却没有带来经济效益。“据估算新建一处50亩左右的公墓，包括土地出让金、墓穴及附属设施建设、硬化绿化等费用在内，总投入达上千万元，这对基层财政来说都是一笔不小的支出。”有的地方由于农村公墓是散坟，并且坐落在自家耕地中，因此与社会经济发展之间并没有很多冲突，所以当地政府只能看到短期投入带来的经济效益，而忽视了节地生态安葬与营造高质量人居环境之间的长远联系，推进农村地区公益性公墓建设的主动性不高，工作执行力不强。
4、农村墓地缺乏规范管理，安全隐患普遍存在
由于农村墓地大多是各自地头，缺乏日常维护管理，散落分布既没有绿化处理也没有道路通达，形象与村庄整体风貌不协调，与乡风文明的标准要求还有很大差距。并且在祭祀期间，烧纸拜香增加了火灾发生的可能性，存在很大的安全隐患。